Vyriausybė pritarė Saulėlydžio komisijos siūlymui pakeisti Valstybinio mokslo ir studijų fondo statusą. Tai turėtų būti institucija, atskaitinga nebe Vyriausybei, o Švietimo ir mokslo ministerijai. Ji taptų Valstybiniu studijų fondu, praneša Vyriausybės spaudos tarnyba.
Taip siekiama sustiprinti atsakomybę už valstybės politikos studijų srityje įgyvendinimą, centralizuoti mokslui skirtų lėšų valdymą ir panaikinti su mokslo bei technologijų programomis susijusių funkcijų dubliavimą. Valstybiniam studijų fondui būtų pavesta administruoti naujas finansavimo priemones studentams.
Savo ruožtu pritarta ir kitam Saulėlydžio komisijos siūlymui – Mokslo tarybai perduoti Valstybinio mokslo ir studijų fondo paramos teikimo moksliniams tyrimams ir eksperimentinei plėtrai bei kitas su mokslu susijusias funkcijas ir vykdytas programas. Mokslo taryba taip pat vykdys Tarptautinių mokslo ir technologijų plėtros programų agentūros funkciją.
Valstybės valdymo tobulinimo komisija siūlo Vyriausybei spręsti ir Mokslo tarybos statusą, nes besikeičiant Mokslo tarybos atliekamoms funkcijoms ir pobūdžiui, turėtų keistis ir Mokslo tarybos vieta valstybės valdymo institucinėje sąrangoje.
Atlikusi išsamią analizę, Saulėlydžio komisija taip pat siūlo Tarptautinių mokslo ir technologijų plėtros programų agentūros pagrindu steigti Inovacijų agentūrą.
Kad šie Saulėlydžio komisijos pasiūlymai, kuriems pritarė Ministrų kabinetas, būtų įgyvendinti, Švietimo ir mokslo ministerijai iki 2009 m. birželio 1 d. pavesta pateikti Vyriausybei nutarimo projektą dėl Valstybinio mokslo ir studijų fondo, kartu su Socialinės apsaugos ir darbo ministerija išnagrinėti socialinių stipendijų administravimo tobulinimo galimybes bei pateikti Vyriausybei reikalingų teisės aktų projektus. Švietimo ir mokslo ministerija, kartu su Ūkio ministerija turės parengti ir pateikti Saulėlydžio komisijai Inovacijų agentūros veiklos koncepcijos projektą.