2008 m. liepos 9 d. Lietuvos Respublikos Vyriausybės posėdyje nutarta pakeisti Lietuvos Respublikos ryšių reguliavimo tarnybos (RRT) nuostatus, RRT suteikiant teisę vykdyti nacionalinio elektroninių ryšių tinklų ir informacijos saugumo incidentų tyrimo padalinio CERT veiklą.
2006 m. rudenį RRT įkurta Tinklų ir informacijos saugumo incidentų tyrimų grupė CERT-RRT, kurios pagrindu ir formuojamas nacionalinis CERT, iki 2008 m. I pusmečio pabaigos ištyrė 567 incidentus elektroninėje erdvėje.
Nacionaliniam CERT padaliniui yra numatomos nacionalinio koordinatoriaus funkcijos, t. y. reaguodamas į elektroninio ryšio saugumo incidentus ir atlikdamas tyrimus, padalinys bus įgaliotas vykdyti veiksmų koordinavimą su kitų valstybių nacionaliniais CERT, imtis veiksmų jų prašymu, operatyviai keistis informacija apie incidentus su vietiniais CERT ir interneto paslaugų teikėjais.
Nacionalinio CERT veikla siekiama sutelkti elektroninių ryšių tinklų administratorių pastangas, kovojant su incidentais elektroninėje erdvėje ir vykdant jų prevenciją, užtikrinti suderintus veiksmus bei efektyvią informacijos sklaidą, siekiant operatyviai reaguoti į kylančias ir iškilusias grėsmes bei atliekant incidentų tyrimus. Nacionalinio CERT veikla prisidės prie saugesnės elektroninės erdvės kūrimo, saugesnio interneto naudojimo skatinimo bei vartotojų pasitikėjimo informacinėmis technologijomis didinimo.